债务纠纷通常属于民事范畴，一般情况下不会在法院留下案底。案底通常是指刑事犯罪记录，而债务纠纷被起诉后，相关的诉讼信息会被记录在司法系统中，包括起诉时间、双方诉求、庭审过程等细节，这些记录主要用于该债务纠纷案件的处理和归档，属于民事诉讼记录，与刑事犯罪记录有着本质的区别。
然而，如果在债务纠纷过程中，当事人存在一些特定的违法犯罪行为，则可能会留下案底。比如，债务人有能力执行法院判决却拒不执行，情节严重的，可能会构成拒不执行判决、裁定罪，一旦被定罪量刑，就会留下案底。另外，如果当事人在诉讼过程中存在虚假陈述、伪造证据等违法违规行为，情节严重构成犯罪的，也会留下刑事案底。
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